舟山普陀山机场1997年8月8日正式建成通航，定名舟山朱家尖机场，1998年4月更名为舟山普陀山机场。
据2019年6月机场官网信息显示，舟山普陀山机场拥有一座航站楼，为T1（中国国内），共0.64万平方米；共有一条跑道，跑道长度为2500米；停机坪总面积为5.2万平方米，可满足高峰小时客流量600人次，年吞吐旅客能力可达80万人次。据2019年5月机场官网信息显示，共开通中国国内航线14条，通航城市13个 。
2018年，舟山普陀山机场旅客吞吐量120.96万人次，同比增长18.2%；货邮吞吐量0.01万吨，同比减少42.9%；起降架次2.45万架次，同比增长9.6%；分别位居中国第87、第176、第80位。
1988年3月，经中华人民共和国国务院、中华人民共和国中央军事委员会批准，舟山市人民政府决定在朱家尖岛曙光农场新建地方民航机场，并命名为“舟山朱家尖机场”。
1995年1月，舟山朱家尖机场开工建设。
1997年3月，舟山朱家尖机场全部竣工。7月28日，舟山朱家尖机场举行首航典礼；8月8日，舟山朱家尖机场正式通航。
1998年4月，“舟山朱家尖机场”正式更名为“舟山普陀山机场”。1998年7月，舟山普陀山机场飞行区等级从3C级升为4C级。
1999年12月，舟山普陀山机场飞行区等级从4C级升为4D级。
2017年4月21日，时任浙江省委书记、浙江省人大常委会主任夏宝龙到普陀山机场，考察航站楼改扩建工程。
2015年7月23日，舟山普陀山机场航站楼改扩建工程初步设计通过民航行业专家和舟山市有关部门联合评审。
2016年5月26日，经中国民用航空局批准，舟山普陀山机场18号跑道一类盲降系统正式启用。12月8日，舟山普陀山机场国际口岸开放航站区扩建工程可行性研究报告（代项目建议书）通过中国民用航空华东地区管理局评审。
2018年2月，中华人民共和国国务院正式批复同意浙江普陀山机场对外开放，主要服务于波音项目与航空产业园的发展。